Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Frmpd1A2AKB4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Frmpd1A2AKB4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms