Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34dA2AGU5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34dA2AGU5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms