Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms