Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms