Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nlrp1bA1Z198 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nlrp1bA1Z198 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms