Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trav12-2A0N8N6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trav12-2A0N8N6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trav12-2A0N8N6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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