Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930469K13RikA0A286YDB2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms