Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AW822073A0A0N4SUK1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AW822073A0A0N4SUK1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms