Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv26A0A0B4J1P5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms