Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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