Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrit3W8DXL4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms