Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5114W4VSN8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms