Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3550W4VSN7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3550W4VSN7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms