Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm26992S4R1A3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm26992S4R1A3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm26992S4R1A3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm26992S4R1A3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm26992S4R1A3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm26992S4R1A3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm26992S4R1A3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm26992S4R1A3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm26992S4R1A3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm26992S4R1A3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm26992S4R1A3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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