Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nek4Q9Z1J2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek4Q9Z1J2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms