Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi4Q9Z183 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi4Q9Z183 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi4Q9Z183 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms