Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cpne6Q9Z140 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms