Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z117

Zfp53, KRAB-containing zinc-finger protein KRAZ1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp53Q9Z117 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp53Q9Z117 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp53Q9Z117 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms