Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms