Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AtrnQ9WU60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrnQ9WU60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtrnQ9WU60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms