Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfdn5Q9WU28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn5Q9WU28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms