Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PplQ9R269 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PplQ9R269 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PplQ9R269 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PplQ9R269 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PplQ9R269 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PplQ9R269 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms