Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TapbpQ9R233 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms