Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma4Q9R1P0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma4Q9R1P0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms