Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms