Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab1Q9R078 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab1Q9R078 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms