Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fhl3Q9R059 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms