Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp21Q9QZL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms