Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ripk3Q9QZL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk3Q9QZL0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms