Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ercc4Q9QZD4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ercc4Q9QZD4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms