Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt3Q9QZ47 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt3Q9QZ47 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms