Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vnn3Q9QZ25 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vnn3Q9QZ25 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms