Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx4Q9QY61 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx4Q9QY61 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms