Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf354bQ9QXT9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf354bQ9QXT9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354bQ9QXT9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354bQ9QXT9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms