Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-OaQ9QWV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-OaQ9QWV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-OaQ9QWV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms