Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psma6Q9QUM9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma6Q9QUM9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms