Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Tgm1Q9JLF6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Tgm1Q9JLF6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Tgm1Q9JLF6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms