Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem3Q9JKE1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms