Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap3m1Q9JKC8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ap3m1Q9JKC8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ap3m1Q9JKC8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3m1Q9JKC8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap3m1Q9JKC8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms