Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msgn1Q9JK54 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msgn1Q9JK54 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msgn1Q9JK54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms