Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl3Q9JJR7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms