Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssna1Q9JJ94 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssna1Q9JJ94 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms