Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copb1Q9JIF7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Copb1Q9JIF7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb1Q9JIF7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb1Q9JIF7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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