Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms