Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ush1cQ9ES64 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms