Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenofQ9ERR7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms