Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ripk4Q9ERK0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk4Q9ERK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms