Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr61Q9ERF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms