Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2Q9ERA0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2Q9ERA0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms