Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms